Вопросы с тегом 'rstan'

Количество результатов: 39

1 голос
1 ответ
эффективное число

В книге Гельмана, эффективное число определяется в терминах следующего; R шляпа between- в пределах последовательности MCMC дисперсии, B а также W число выборок MCMC...

3 голоса
1 ответ
ZIP - скрытые модели Маркова г Стан

Я пытаюсь настроить нулевую Завышенный Пуассон скрытой марковской модели с Станом. Для Пуассона-НММ в прошлом форуме эта установка была показана. см ссылку. Несмотря ...

0 голосов
1 ответ
Как итеративно соответствовать BRMS регрессионной модели и извлечь средства и сигмы к dataframe

Учитывая данные выборки sampleDT ниже, я был бы признателен за любую помощь, чтобы итеративно соответствовать модели BRMs ниже п раз, и каждый раз, извлечь means а так...

0 голосов
1 ответ
Как получить доступ к второму индексу массива размерности с Bayesplot?

Я пытаюсь построить задние участки с Bayesplot для матрицы параметров. Я не был в состоянии использовать второй индекс размера массива в pars аргумент, чтобы успешно п...

1 голос
1 ответ
Интеграция в rstan

Является ли вычисление двойного интегрирования можно в «RStan»? Я нашел в этой ссылке кПК-в-Стан что одна мерная интеграция происходит очень медленно. Обратите вниман...

1 голос
1 ответ
Извлечение и добавить к кадру данных значений сигмы от распределительной линейной модели стана

Учитывая данные выборки sampleDT и brms модели brm.fit а также brm.fit.distr ниже, я хотел бы: оценка, извлечь и добавить к кадру данных значения стандарта   откло...

2 голоса
1 ответ
Извлечение и добавить к значениям данных функции плотности вероятности на основе линейной модели стана

Учитывая данные выборки sampleDT и модели lm.fit а также brm.fit ниже, я хотел бы: оценка, извлечь и добавить в кадр данных, значения плотности   Функция для услов...

0 голосов
2 ответа
Пропустить конкретный тестовый файл на Трэвиса в R

мой testing Suite состоит из нескольких файлов. Я хотел бы, чтобы пропустить один из них на Трэвисе (тот, связанный с фитинговой байесовской моделью), так как это зани...

0 голосов
1 ответ
Как эффективно определить большую матрицу предсказателя для блока данных стана

Я был бы признателен за любую помощь, чтобы создать большую матрицу предсказателя для блока данных Стана. Я хочу использовать переменные w_1 в w_K из данных ниже как ...

2 голоса
0 ответов
Как передать несколько столбцов весов в BRMS

Я был бы признателен за любую помощь, чтобы указать свою модель BRMs ниже, для того, чтобы быть в состоянии пройти несколько колонок веса модели, как показано в stan c...

1 голос
0 ответов
Как обновить объект brmsfit с модифицированным BRMS сгенерированного станом моделью маргинализацией над распределением веса

Буду признательна за любую помощь, чтобы обновить свой объект brmsfit с модифицированным BRMs-сгенерированным стан моделью, потому что я хочу, чтобы передать различные...

0 голосов
0 ответов
Протоколирование сообщений R и ошибок при использовании future.batchtools

Я использовал, чтобы иметь возможность контролировать работу на нашем Torque/PBS вычислительного кластера, глядя на лог-файлов из задания. Я (или пакет я использую), д...

0 голосов
0 ответов
Иерархическая Линейная смесь Модель

Я реализовал иерархическую модель с уровнем стана 1 внутри групп, чтобы быть линейной моделью и 2-го уровня в пределах субъектов гауссова модель смеси. Это означает на...

0 голосов
1 ответ
Как предотвратить открытие/TMP файлов с помощью knitr nvim-р и rstan

Я использую R в neovim с nvim-р вязать документы RMD с использованием \kh или же \kp команды. Проблема заключается в том, когда я вязать в RMD, который соответствует м...

2 голоса
1 ответ
Как извлечь из оценки объекта stanfit

Позволять fit быть stanfit объект. Тогда я могу извлечь оценки параметра AAA следующим образом: Ожидаемый апостериорный EAP <- as.data.frame(summary(fit)[[1]]...

2 голоса
0 ответов
Как подобрать и объединить подмодели в один объект stanfit

Буду признателен за любую помощь, чтобы сделать это: для каждого P подходит модель для каждого столбца weights. выполните шаг 1 для всех наблюдений в наборе д...

1 голос
1 ответ
Как указать матрицу предиктора для блока данных stan?

Уважаемое сообщество stackoverflow. Я хочу использовать переменные от w1 до w10 в качестве матрицы предиктора matrix[N, W] weights; в моей модели Стэн. Я не уверен, ка...

2 голоса
1 ответ
перекомпиляция во избежание сбоя R сессии

Как избежать перекомпиляции? мой stan() перекомпилируется, чтобы избежать сбоя сеанса R. Чтобы проверить мою модель, я хочу скопировать различные модели для многих д...

0 голосов
1 ответ
Как указать наивысший компонент индексированного массива?

Предположим, что следующее в стандартном файле. transformed parameters { real <lower=0,upper=1>p[C]; } где C является положительным целым числом, указанны...

0 голосов
1 ответ
Фитинг пуассоновский модель HMM JAGS с RSTAN

Вальтер Цуккини в своей книге Скрытые марковские модели для временных рядов Введение с использованием R, в главе 8, стр. 129, настраивает Poisson HMM с помощью R2OpenB...

0 голосов
1 ответ
Есть ли функция check_rhat() в пакете rstan?

На следующей странице я нахожу функцию check_rhat(). Однако в консоли R не существует даже при использовании rstan:::. Итак, я сделал аналогичную функцию для диагност...

2 голоса
0 ответов
Как эффективно распараллелить brms :: brm?

Краткое описание проблемы Я примеряю brms::brm_multiple() модели в большой набор данных, где отсутствующие данные были вменены с использованием mice пакет. Размер наб...

0 голосов
1 ответ
Что такое «linear.predictors» как извлекаемые из stan_glm() объекта в пакете «rstanarm»?

Я пишу, чтобы выяснить, что "linear.predictors" как возвращено stan_glm() объект. По всей видимости, "linear.predictors" это не то же самое, как предсказатель (с), пр...

0 голосов
1 ответ
"Линия()" действует как "полигон()" R?

Я пытаюсь нарисовать две черные линии вокруг красной линии регрессии. Но lines() команда рисует что-то больше похоже на polygon() чем простая линия (см рисунок ниже ко...

2 голоса
1 ответ
Построение модели с изменяющимся перехватывающей в RStan - сообщение об ошибке

Я пытаюсь построить изменяющуюся-перехватывающую модель в RStan, пытаясь предсказать использование женского противозачаточного средств в одном регионе Индии в зависимо...

0 голосов
1 ответ
Проблемный `rstanarm :: stan_lmer` - недопустимый внутренний Подменю

Я бегу в следующей задаче, которая, как представляется, связано с Подменю сделано в rstanarm. Видеть это связано проблема Ошибка в Xj [я]: недопустимый тип подстро...

5 голосов
2 ответа
Как использовать стан в rmarkdown

Я хотел бы получить расчетные коэффициенты модели с использованием rstan в rnotebook У меня есть следующие stan кусок: ```{stan output.var="rats"} data { int<lo...

4 голоса
1 ответ
Оптимизация гауссовского процесса в Stan/rstan

Недавно я столкнулся с гауссовых моделей процессов и случается, думаю, что они могут быть решением проблемы, я работал в моей лаборатории. У меня есть открытый и связа...

0 голосов
1 ответ
Отображение гауссовского процесса в R с использованием rstan

Я пытаюсь понять, где я иду не так rstan. Я нашел обходной путь, но, похоже, должен быть лучший вариант для рисования отрисовок сзади, чем то, что я придумал. Я пыта...

0 голосов
1 ответ
Ошибка компиляции модели окон Rstan 7 профессиональных 64 бит

Я получаю сообщение об ошибке при попытке подобрать модель стана в R на окна работы машины, я уверен, что нет никакой проблемы с моим кодированием, так как все это пре...

0 голосов
0 ответов
Rstan не работает без подключения к интернету на Mac

Когда rstan начинает компилировать модель, а я не подключен к Интернету, он останавливается и выдает ошибку, связанную с завитком. Я предполагаю, что это потому, что р...

1 голос
1 ответ
Оценка назначения кластера с использованием Stan

Я пытаюсь согласовать модель конечной гауссовой смеси с неизвестным средним и ковариациями, используя Стэна. Мне известно, что, поскольку HMC нельзя применять к выборк...

1 голос
2 ответа
Смешение Модель в Стане - векторизации

Сейчас я учусь Стэн и хотел реализовать простую модель смеси. В справочном руководстве (Стан-ссылки 2.14.0) есть решение уже: data { int<lower=1> K; // numbe...

0 голосов
0 ответов
Развертывание предварительно скомпилированных модели RStan и избежать перекомпиляции

Теперь я был на этом в течение нескольких часов. Я скомпилировать модель стана со следующим кодом: model <- stan(file = "model.stan", data = data, save_dso = FALS...

1 голос
1 ответ
RStan: Использование матрицы в ordered_logistic()

Я хотел бы использовать ordered_logistic() функция RStan. Во-первых, здесь есть данные (sample): gender age partyID treatment_rand treatment_bias y_randT y_bias...

0 голосов
1 ответ
Построение нелинейной экспоненциальной модели - использовать вектор или действительное?

Я новичок в Стене и вероятностном программировании. Я пытаюсь построить нелинейную модель роста. Я был в состоянии построить модель в NLS Формула NLS, которую я испол...

0 голосов
0 ответов
RStan: правильное обновление для "poisson_log" функция

Я пытался заставить Stan-версию старого примера BUGS «leuk» работать, используя версию с github.com/stan-dev/example-models. Версия leuk.stan там работает нормально, н...

4 голоса
3 ответа
Смешанная Парето и модель Нормальный Стэн не работает

Я пытаюсь научиться Стэн через rstan (так как я знаком с R). Я попытался запустить простой смешанный Парето и нормальная модель. Он отлично компилируется (насколько я ...

0 голосов
1 ответ
Установка rstan на кластере

При установке rstan на кластере, как нужно идти о выборе количества ядер, чтобы использовать для сборки (в строке Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4" описано в документация)?...